El clima de Caparroso es de tipo mediterráneo-continental con inviernos fríos (4,9 ºC de media en Enero) y veranos cálidos (23,9 ºC de media en Agosto), lluvias escasas (424 mm anuales caídos en unos 65 días) e irregulares y con una aridez de alrededor de 750 mm de evapo-transpiración potencial acentuada por el soplo frecuente del cierzo.

Fuera del río Aragón que aquí tiene un caudal de unos 81 m/s, sólo hay barrancos que han excavado valles anchos llamados en navarro- aragonés, Vales.

El Cierzo es importante protagonista de las actividades de este paisaje y desde luego se acusa una mayor irregularidad anual en la cuantía y régimen de precipitaciones.